Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Derl3Q9D8K3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms