Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms