Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
U2af1Q9D883 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
U2af1Q9D883 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2af1Q9D883 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.7 ms