Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chmp4cQ9D7F7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp4cQ9D7F7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms