Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs8Q9D6Y4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms