Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2al3Q9D4U4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2al3Q9D4U4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms