Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam90a1bQ9D4F3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam90a1bQ9D4F3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam90a1bQ9D4F3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam90a1bQ9D4F3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam90a1bQ9D4F3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam90a1bQ9D4F3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam90a1bQ9D4F3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms