Protein–RNA interactions for Protein: Q9D411

Tssk4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk4Q9D411 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tssk4Q9D411 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms