Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trmt44Q9D2Q2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trmt44Q9D2Q2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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