Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fndc8Q9D2H8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fndc8Q9D2H8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms