Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Necap2Q9D1J1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Necap2Q9D1J1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms