Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl28Q9D1B9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl28Q9D1B9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl28Q9D1B9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.4 ms