Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmem88Q9D0N8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem88Q9D0N8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms