Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Xrcc3Q9CXE6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Xrcc3Q9CXE6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Xrcc3Q9CXE6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xrcc3Q9CXE6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Xrcc3Q9CXE6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Xrcc3Q9CXE6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Xrcc3Q9CXE6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Xrcc3Q9CXE6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xrcc3Q9CXE6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Xrcc3Q9CXE6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xrcc3Q9CXE6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xrcc3Q9CXE6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xrcc3Q9CXE6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xrcc3Q9CXE6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xrcc3Q9CXE6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xrcc3Q9CXE6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Xrcc3Q9CXE6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Xrcc3Q9CXE6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Xrcc3Q9CXE6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Xrcc3Q9CXE6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Xrcc3Q9CXE6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Xrcc3Q9CXE6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Xrcc3Q9CXE6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Xrcc3Q9CXE6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Xrcc3Q9CXE6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xrcc3Q9CXE6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms