Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Malsu1Q9CWV0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms