Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pfdn1Q9CWM4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms