Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp13a2Q9CTG6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp13a2Q9CTG6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp13a2Q9CTG6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp13a2Q9CTG6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp13a2Q9CTG6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp13a2Q9CTG6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp13a2Q9CTG6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp13a2Q9CTG6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp13a2Q9CTG6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp13a2Q9CTG6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp13a2Q9CTG6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp13a2Q9CTG6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp13a2Q9CTG6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp13a2Q9CTG6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp13a2Q9CTG6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp13a2Q9CTG6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms