Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pard3bQ9CSB4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pard3bQ9CSB4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms