Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NmbQ9CR53 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NmbQ9CR53 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms