Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ykt6Q9CQW1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms