Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PompQ9CQT5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PompQ9CQT5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms