Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudcd2Q9CQ48 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudcd2Q9CQ48 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms