Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vgll1Q99NC0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.4 ms