Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brms1Q99N20 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brms1Q99N20 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms