Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CalcbQ99MP3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CalcbQ99MP3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CalcbQ99MP3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CalcbQ99MP3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CalcbQ99MP3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CalcbQ99MP3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CalcbQ99MP3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CalcbQ99MP3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CalcbQ99MP3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CalcbQ99MP3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CalcbQ99MP3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CalcbQ99MP3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CalcbQ99MP3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CalcbQ99MP3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CalcbQ99MP3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CalcbQ99MP3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CalcbQ99MP3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CalcbQ99MP3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CalcbQ99MP3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CalcbQ99MP3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CalcbQ99MP3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CalcbQ99MP3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CalcbQ99MP3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms