Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnpo2Q99LG2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnpo2Q99LG2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms