Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Usp16Q99LG0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Usp16Q99LG0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp16Q99LG0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms