Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Clint1Q99KN9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clint1Q99KN9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 233.4 ms