Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX7

Nxf1, Nuclear RNA export factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf1Q99JX7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nxf1Q99JX7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nxf1Q99JX7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms