Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdelr1Q99JH8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdelr1Q99JH8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdelr1Q99JH8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdelr1Q99JH8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdelr1Q99JH8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdelr1Q99JH8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdelr1Q99JH8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdelr1Q99JH8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdelr1Q99JH8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdelr1Q99JH8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms