Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pacsin3Q99JB8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin3Q99JB8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms