Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sf3b5Q923D4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b5Q923D4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms