Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smc1bQ920F6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smc1bQ920F6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Smc1bQ920F6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smc1bQ920F6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smc1bQ920F6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smc1bQ920F6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smc1bQ920F6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smc1bQ920F6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smc1bQ920F6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Smc1bQ920F6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smc1bQ920F6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smc1bQ920F6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smc1bQ920F6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smc1bQ920F6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smc1bQ920F6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smc1bQ920F6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smc1bQ920F6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smc1bQ920F6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smc1bQ920F6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smc1bQ920F6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms