Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Creb3l3Q91XE9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Creb3l3Q91XE9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Creb3l3Q91XE9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Creb3l3Q91XE9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Creb3l3Q91XE9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Creb3l3Q91XE9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Creb3l3Q91XE9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Creb3l3Q91XE9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Creb3l3Q91XE9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Creb3l3Q91XE9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Creb3l3Q91XE9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Creb3l3Q91XE9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Creb3l3Q91XE9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Creb3l3Q91XE9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Creb3l3Q91XE9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Creb3l3Q91XE9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Creb3l3Q91XE9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Creb3l3Q91XE9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Creb3l3Q91XE9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Creb3l3Q91XE9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms