Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG1

Rest, RE1-silencing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RestQ8VIG1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RestQ8VIG1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RestQ8VIG1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RestQ8VIG1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms