Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ppargc1bQ8VHJ7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ppargc1bQ8VHJ7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.7 ms