Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHI4

Carf, Calcium-responsive transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CarfQ8VHI4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CarfQ8VHI4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CarfQ8VHI4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CarfQ8VHI4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CarfQ8VHI4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CarfQ8VHI4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CarfQ8VHI4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CarfQ8VHI4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CarfQ8VHI4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CarfQ8VHI4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CarfQ8VHI4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CarfQ8VHI4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CarfQ8VHI4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CarfQ8VHI4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CarfQ8VHI4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CarfQ8VHI4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CarfQ8VHI4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CarfQ8VHI4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CarfQ8VHI4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CarfQ8VHI4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CarfQ8VHI4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CarfQ8VHI4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CarfQ8VHI4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CarfQ8VHI4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CarfQ8VHI4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CarfQ8VHI4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CarfQ8VHI4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CarfQ8VHI4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CarfQ8VHI4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CarfQ8VHI4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CarfQ8VHI4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CarfQ8VHI4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CarfQ8VHI4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CarfQ8VHI4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CarfQ8VHI4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CarfQ8VHI4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CarfQ8VHI4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CarfQ8VHI4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CarfQ8VHI4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CarfQ8VHI4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CarfQ8VHI4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CarfQ8VHI4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CarfQ8VHI4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CarfQ8VHI4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CarfQ8VHI4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CarfQ8VHI4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CarfQ8VHI4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CarfQ8VHI4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CarfQ8VHI4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CarfQ8VHI4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms