Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt79Q8VED5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt79Q8VED5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms