Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc115Q8VE99 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc115Q8VE99 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms