Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc9Q8VC31 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc9Q8VC31 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms