Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Top1mtQ8R4U6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Top1mtQ8R4U6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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