Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11fip5Q8R361 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11fip5Q8R361 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11fip5Q8R361 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11fip5Q8R361 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11fip5Q8R361 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab11fip5Q8R361 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab11fip5Q8R361 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab11fip5Q8R361 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab11fip5Q8R361 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab11fip5Q8R361 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab11fip5Q8R361 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab11fip5Q8R361 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab11fip5Q8R361 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab11fip5Q8R361 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab11fip5Q8R361 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip5Q8R361 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip5Q8R361 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab11fip5Q8R361 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab11fip5Q8R361 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab11fip5Q8R361 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab11fip5Q8R361 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab11fip5Q8R361 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab11fip5Q8R361 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab11fip5Q8R361 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11fip5Q8R361 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11fip5Q8R361 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11fip5Q8R361 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11fip5Q8R361 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11fip5Q8R361 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11fip5Q8R361 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11fip5Q8R361 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11fip5Q8R361 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11fip5Q8R361 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip5Q8R361 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip5Q8R361 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip5Q8R361 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip5Q8R361 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip5Q8R361 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip5Q8R361 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip5Q8R361 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip5Q8R361 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip5Q8R361 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip5Q8R361 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip5Q8R361 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip5Q8R361 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip5Q8R361 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip5Q8R361 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip5Q8R361 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip5Q8R361 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms