Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim29Q8R2Q0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139 ms