Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b4Q8QZY9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms