Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Colec12Q8K4Q8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Colec12Q8K4Q8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Colec12Q8K4Q8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms