Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trappc12Q8K2L8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Trappc12Q8K2L8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trappc12Q8K2L8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trappc12Q8K2L8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trappc12Q8K2L8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trappc12Q8K2L8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trappc12Q8K2L8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trappc12Q8K2L8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trappc12Q8K2L8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trappc12Q8K2L8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc12Q8K2L8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc12Q8K2L8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc12Q8K2L8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc12Q8K2L8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc12Q8K2L8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc12Q8K2L8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc12Q8K2L8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc12Q8K2L8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc12Q8K2L8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc12Q8K2L8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc12Q8K2L8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc12Q8K2L8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc12Q8K2L8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc12Q8K2L8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc12Q8K2L8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc12Q8K2L8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc12Q8K2L8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc12Q8K2L8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc12Q8K2L8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms