Protein–RNA interactions for Protein: Q8K297

Colgalt1, Procollagen galactosyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt1Q8K297 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Colgalt1Q8K297 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Colgalt1Q8K297 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms