Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJF8

Ago4, Protein argonaute-4, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ago4Q8CJF8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ago4Q8CJF8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ago4Q8CJF8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ago4Q8CJF8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ago4Q8CJF8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ago4Q8CJF8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ago4Q8CJF8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ago4Q8CJF8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ago4Q8CJF8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ago4Q8CJF8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ago4Q8CJF8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ago4Q8CJF8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ago4Q8CJF8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ago4Q8CJF8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ago4Q8CJF8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ago4Q8CJF8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ago4Q8CJF8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ago4Q8CJF8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ago4Q8CJF8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ago4Q8CJF8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ago4Q8CJF8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ago4Q8CJF8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ago4Q8CJF8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ago4Q8CJF8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ago4Q8CJF8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ago4Q8CJF8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ago4Q8CJF8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ago4Q8CJF8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ago4Q8CJF8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ago4Q8CJF8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.1 ms