Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIN6

Celf3, CUGBP Elav-like family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf3Q8CIN6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Celf3Q8CIN6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Celf3Q8CIN6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Celf3Q8CIN6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Celf3Q8CIN6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Celf3Q8CIN6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Celf3Q8CIN6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Celf3Q8CIN6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Celf3Q8CIN6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Celf3Q8CIN6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Celf3Q8CIN6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Celf3Q8CIN6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Celf3Q8CIN6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Celf3Q8CIN6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Celf3Q8CIN6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Celf3Q8CIN6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Celf3Q8CIN6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Celf3Q8CIN6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms