Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Syne4Q8CII8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syne4Q8CII8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syne4Q8CII8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms